V základě je hypotalamus svazek vláken a buněk uprostřed lebky v mezimozku. Podílí se skoro na všech funkcích endokrinních žláz. Očí, sluchových orgánů, látkové výměny, krevního tlaku (a to jak nízkého, tak vysokého), vylučování tekutin, rovnováze vody v těle, řízení teploty, chuti k jídlu, hladu, fenoménu spánku. Prakticky každá duševní a tělesná funkce a činnost je určitým způsobem přímo nebo nepřímo ovlivňována činností hypotalamu. Od testosteronu odvozený feromon, který se označuje také jako AND, a je součástí mužského potu, aktivuje přední část hypotalamu - vnitřní preoptickou oblast (zbarveno oranžově) a to jak u žen, tak u gayů.